Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shq1Q7TMX5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms