Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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NipblQ6KCD5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
NipblQ6KCD5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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