Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tpm4Q6IRU2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms