Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9aQ68FE2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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