Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SspnQ62147 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SspnQ62147 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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SspnQ62147 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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