Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sft2d1Q5SSN7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms