Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Trappc1Q5NCF2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms