Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rtl6Q505G4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rtl6Q505G4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rtl6Q505G4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rtl6Q505G4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rtl6Q505G4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rtl6Q505G4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Rtl6Q505G4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Rtl6Q505G4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rtl6Q505G4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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