Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
R3hdm4Q4VBF2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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