Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms