Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Chpf2Q3UU43 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Chpf2Q3UU43 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Chpf2Q3UU43 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Chpf2Q3UU43 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chpf2Q3UU43 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms