Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms