Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q3U1D9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U1D9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms