Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms