Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prr27Q3SYJ2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms