Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ttc39dQ0VF76 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ttc39dQ0VF76 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39dQ0VF76 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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