Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttc21bQ0HA38 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms