Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Nfe2Q07279 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nfe2Q07279 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms