Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gjb5Q02739 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms