Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lsm5P62322 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms