Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ufm1P61961 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms