Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf5P56477 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Irf5P56477 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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