Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
AgrpP56473 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
AgrpP56473 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms