Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms