Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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VdrP48281 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VdrP48281 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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VdrP48281 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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VdrP48281 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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VdrP48281 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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