Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TgfaP48030 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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