Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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