Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TpoP35419 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TpoP35419 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TpoP35419 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms