Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3aP23116 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3aP23116 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3aP23116 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3aP23116 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3aP23116 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3aP23116 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3aP23116 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3aP23116 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3aP23116 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3aP23116 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3aP23116 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms