Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkcaP20444 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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