Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb1P13372 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms