Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P10404 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P10404 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P10404 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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