Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms