Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccdc6D3YZP9 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccdc6D3YZP9 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccdc6D3YZP9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccdc6D3YZP9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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