Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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