Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms