Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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