Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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