Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mbd1Q9Z2E2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mbd1Q9Z2E2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms