Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Setbp1Q9Z180 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Setbp1Q9Z180 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Setbp1Q9Z180 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Setbp1Q9Z180 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms