Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trp53inp1Q9QXE4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trp53inp1Q9QXE4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trp53inp1Q9QXE4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms