Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrQ9JKK8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrQ9JKK8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms