Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nectin1Q9JKF6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nectin1Q9JKF6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms