Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl3Q9JKB1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl3Q9JKB1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl3Q9JKB1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms