Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lima1Q9ERG0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lima1Q9ERG0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms