Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tsc1Q9EP53 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsc1Q9EP53 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsc1Q9EP53 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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