Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syde1Q9DBZ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syde1Q9DBZ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syde1Q9DBZ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms