Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptp4a3Q9D658 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ptp4a3Q9D658 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Ptp4a3Q9D658 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Ptp4a3Q9D658 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ptp4a3Q9D658 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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Ptp4a3Q9D658 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Ptp4a3Q9D658 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ptp4a3Q9D658 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Ptp4a3Q9D658 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptp4a3Q9D658 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms