Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
4930583I09RikQ9D2E3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930583I09RikQ9D2E3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms