Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndc80Q9D0F1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndc80Q9D0F1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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